第二季会接力第一季的剧情，把最终没有完结的战斗以新篇章的形式给大家补充完整，剧情看点与握有钥匙的水泽葵、影月明、若叶皆实一起，如今的莲正迈出通往谜团的一步，对于前方沉睡着无法想象的真相一事，仍然一无所知。
在美丽的多多岛上，热心助人的托马斯是一辆可爱的火车头，他喜欢帮助别人，不过常常因为过分热心而令自己卷入麻烦中。但是他乐观开朗，很快就会忘记不愉快的事，所以时常都是笑口常开、心情愉快。托马斯有很多的火车好朋友，他们团结友爱、互相帮助并且勤奋热情地工作，他们每天都会接载不同的乘客，因而发生了不少趣事
