在明治的新京都，佩戴着［许可证］的妖怪也在四下飞奔，在得到由官方发放的许可证后，可以和人类一起生活。其中，有一个专门逮捕没有得到许可证的妖怪人，以此来捍卫京都的治安的集团在奋斗着。他的名字就是株式会社新撰组。另一方面，时代巨变下杂乱无章的京都中，和伙伴妖怪猫丸一起刚从上海回来的少年出现了。他名叫坂本龙之介，而他将马上回到上海。为了完成收养她们的坂本夫人的愿望，三人而一直努力着留住坂本龙之介。是一部描绘爱情和战争，悲伤却搞笑科幻历史剧。
美丽端庄的伊织（伊藤静 配音）是学校里的风云人物，甚至有狂热的粉丝在学校里专门为她组织了“后援会”。这样的伊织自然也吸引了一贵（野村胜人 配音）的注意，但一贵自知平凡无奇，选择了将感情深深地埋藏在心底。一起意外的发生令伊织陷入了困境，所幸得到了一贵和其好友寺谷（小伏伸之 配音）出手相助，才得以平安度过难关，伊织和一贵之间的关系也因此迎来了新的局面。就在两人距离越来越近之时，一贵久违的青梅竹马逸姬（中世明日香 配音）横插一足，对一贵发起了热烈的进攻，伊织因此误会了一贵真正的心意，在悲伤之中，她决心成全一贵和逸姬。
